Jeśli gracz zabije Alana po tym, jak ten każe mu pójść do Arefu, zwłoki Alana pojawią się w jego mieszkaniu - mimo że zginął on w zupełnie innym miejscu.
Jednym z najczęściej wypowiadanych zdań przez Allena Macka jest: "Nadzorca dowie się o tym!". Wymawia je nawet wtedy, gdy sam piastuje to stanowisko.
Pomimo tego, że Anna Holt zdradziła Projekt Oczyszczenie i współpracuje z Enklawą, zabicie jej skutkuje złą karmą.
Wskutek błędu gry, zabita Anne Marie Morgan odradza się za każdym razem, gdy jej zwłoki znikają z mapy.
Bywa, że Anthony Ling spaceruje w okolicach Krypty 101 lub wysadzonej Megatony. Można z nim wtedy porozmawiać, ale zachowuje się, jakby znajdował się w Tenpenny Tower.
W Krypcie 106 nie ma wewnętrznego panelu umożliwiającego sterowanie wejściem do schronu, przez co można go otworzyć bądź zamknąć tylko z zewnątrz. Biorąc pod uwagę zastosowanie krypty, jest to całkowicie bezsensowne.
W dniu 10. urodzin Samotnego Wędrowca, Jonas Palmer ofiarowuje mu wędrówkę. Może potem zostać postrzelony lub pobity do nieprzytomności. Mimo tego, że zemdlał, robi sobie zdjęcie z Wędrowcem i jego ojcem.
Pomimo tego, że Armitage jest androidem i twierdzi, że mógłby złamać kark Samotnego Wędrowca jak kość kurczaka, nie jest wytrzymalszy od przeciętnego człowieka.
Na zakończenie rozmowy z Samotnym Wędrowcem, Bael mówi "Niech Stal będzie z tobą" lub "Oczywiście". Sęk w tym, że wypowiada te słowa nie swoim, a domyślnym dla Paladynów Bractwa Stali głosem.
Bywa, że Ben Canning jest wrogo nastawiony do Samotnego Wędrowca przy pierwszym spotkaniu z nim, choć nie powinien.
Jedną z mieszkanek Dużego Miasta jest Gorzka. Podczas jednej z wizyt w tej lokacji, wskutek błędu gry, można znaleźć jej zwłoki - kobieta umiera wtedy bez żadnego wyjaśnionego w fabule powodu.
Bywa, że Bleak powtarza zdania takie jak "Muszę stąd uciec" nawet wtedy, gdy Samotny Wędrowiec wydostanie ją z niewoli, zabijając wszystkich łowców niewolników w Paradise Falls.
Mieszkający w Republice Dave'a Bob wygląda jak Azjata, mimo że jego biologiczni rodzice pochodzą z Kaukazu.
Gdy Samotny Wędrowiec pyta Biwwy'ego o drogę do Krypty 87, ten odpowiada zupełnie normalnie, jak gdyby na chwilę pozbył się swojej wady wymowy - rotacyzmu (niewymawiania litery "r").
Bywa, że w rozmowie ze Skrybą Bowditchem (ang. Scribe Bowditch) występuje błąd w skryptach gry, przez co Samotny Wędrowiec zwraca się do niego per "Squire Bowditch".
Bywa, że wskutek błędu gry znak na mapie oznaczający Ernesta Roe wyprowadzi gracza poza mapę, co uniemożliwia wykonanie zadania.
Robot, który nazywa się Button Gwinnett, uważa, że Samotny Wędrowiec jest Thomasem Jeffersonem - nawet jeśli gracz gra jako kobieta.
Nawet jeśli gracz odda państwu Young z Rivet City ich zaginione dzieci, ci nadal będą zachowywać się, jakby szukali swoich pociech - mimo że te znajdują się w tym samym pokoju, co oni.
Bywa, że Carlos bez żadnej logicznej przyczyny ucieka przed graczem, gdy ten do niego podejdzie.
Jeśli gracz ma w swojej drużynie Fawkesa i wejdzie do baru "The Muddy Rudder", Fawkes i Butch DeLoria rzucą się na siebie, choć domyślnie nie są sobie wrodzy.
Choć Carter, niewolnik z Paradise Falls, ma na sobie specjalną obrożę, która eksploduje, gdy jej właściciel oddali się od określonego miejsca, może ona nie wybuchnąć. Mężczyzna staje się wtedy nieruchomy, ale nadal możliwy do zabicia. Ten błąd pojawia się najczęściej wtedy, gdy gracz próbuje porozmawiać z Carterem, podczas gdy ten ucieka z obozu.
Bywa, że wskutek błędu gry przy pierwszej wizycie w Paradise Falls gracz może zobaczyć martwego Cartera. Ten niewolnik nie został jednak zabity przez eksplodującą obrożę, bo jego głowa nadal jest przytwierdzona do reszty ciała.
Postać Cerberusa, robota mającego trzy oczy i trzy ramiona jest inspirowana znanym z mitologii greckiej Cerberem, trzygłowym psem strzegącym wejścia do Hadesu.
Bywa, że Fantazja, prostytutka z domu Dukova, znika bez wieści, bez żadnego podanego w grze powodu.
Jedna z postaci w grze nazywa się RJ McCready. Jest to nawiązanie do filmu "Coś", gdzie nazywał się tak jeden z głównych bohaterów.
Gdy robot Mister Gutsy ginie, jego ostatnie słowa to treść marszowej przyśpiewki z filmu "Full Metal Jacket". Gutsy przybiera wtedy osobowość sierżanta.
Samochody, które pojawiają się w grze, są wzorowane na Fordzie Nucleonie, prototypowym aucie napędzanym silnikiem jądrowym. To wyjaśnia promieniowanie, które emitują zniszczone pojazdy.
Dźwięk, który da się słyszeć przy użyciu małej bomby atomowej, to dzwonek obiadowy Bethesdy.
Po przyjęciu Wyzwania Nuka-Coli w fabryce tego napoju pojawia się robot, który udostępnia hasła do terminali. Hasło to "NCC1864". Jest to nawiązanie do filmu Star Trek II: Gniew Khana, gdzie "NCC1864" to rejestracja statku kosmicznego USS Reliant.
W japońskiej wersji językowej nazwę wyrzutni małych bomb atomowych "Fat Man" (pol. Grubas) zmieniono na "Nuka Launcher", gdyż "Fat Man" to nazwa bomby jądrowej, która w czasie II wojny światowej została zrzucona przez Amerykanów na Nagasaki (Japonia).
Imię Three Doga to nawiązanie do postaci, w którą wcielił się aktor, który podłożył pod niego głos - Erika Dellumsa. Zagrał on Psa 3 w filmie "Ona się doigra".
Kolor skóry i wygląd Jamesa zmieniają w zależności od ustawień wybranych przez gracza podczas tworzenia postaci (syna Jamesa). Zapobiega to sytuacji, w której np. ojciec czarnoskórego bohatera byłby biały.
Anne Marie Morgan nawiązuje do powieści "Moby Dick" autorstwa Hermana Melville'a, nazywając Owyna Lyonsa "Ahabem" (Ahab to bohater książki - ponury i tajemniczy kapitan, który stracił nogę w walce z wielorybem) i stwierdzając, że "goni on swojego zmutowanego białego wieloryba".
Sticky jest jedyną postacią stacjonującą w Latarence, którą można zabić. Wszystkie inne dzieci w całej grze są nieśmiertelne.
Postać Brick jest inspirowana szer. Jenette Vasquez z filmu "Obcy - decydujące starcie", która ma taką samą broń, fryzurę i postawę.
Postać Caleba Smitha nawiązuje do Caleba Blooda Smitha, amerykańskiego dziennikarza i polityka, który pracował w gabinecie Abrahama Lincolna podczas wojny secesyjnej.
W lipcu 2008 r. zakazano dystrybucji gry w Australii, jednak jej ocenzurowane wznowienie zostało później dopuszczone do sprzedaży.
W wersji gry na rynek niemiecki usunięto nie tylko krwawe efekty oraz sceny z pozbawianiem kończyn, ale także odcinanie ramion robota Mistera Gutsy.